Le fidanzate di Francesco Nuti non furono tante, almeno quelle note. Le relazioni del regista e attore di cui si è a conoscenza sono due e riguardano due attrici.
La prima fiamma di Nuti fu Clarissa Burt, nata a Filadelfia il 25 aprile 1959. Una modella e attrice di grande fascino, che ha lavorato per tanti anni in Italia, fino a ricevere la cittadinanza italiana nel 2003.
In una recente intervista, l'attrice ha raccontato alcuni dettagli della sua relazione con il regista, iniziata nel 1987:
La donna più importante nella vita di Francesco Nuti è stata senza dubbio Annamaria Malipiero. La loro relazione durò dal 1992 al 2000 e nel 1999 nacque la loro figlia Ginevra.
A proposito del loro primo incontro, Annamaria dichiarò in un'intervista al programma "Vieni da me":
Malipiero è rimasta una figura costante nella vita di Nuti, anche in seguito al terribile incidente che cambiò per sempre la vita del regista.